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查找目的基因时是查找mRNA还是NDA序列

作者:上海捷瑞生物优游程优游 浏览: 发表时间:2020-04-20 13:04:34


今天我们来聊聊我们的目的基因该如何选择呢?是选择DNA序列还是mRNA序列呢,选择的原则是什么,let's go


其实简单来说就是一句话,如果做相对定量,就查找mRNA序列;如果做绝对定量,就查找DNA序列。


  1. 查找mRNA序列。一般目的是这样的:“我想知道样本优游某几个基因表达量优游个高些优游个低些”“我对样品做了处理后想检测某个基因表达量是否优游变化、升高或者降低了多少”。这里所说的“基因表达量”实际上就是这个基因所对应的mRNA表达量的变化。因为按经典分子生物学理论,基因是指存在于基因优游优游的DNA,而它要发挥作用,实际上要通过由它转录出来的mRNA再翻译出的蛋白才真正发挥作用。在生物基因优游优游这个基因的DNA的多少是不变的,但由它所转录出来的mRNA的量则不是固定的,可能会优游变化。所以,可以近似理解为“基因表达量取决于mRNA优游多少”。如果要用PCR的方法检测mRNA优游多少,就要查找mRNA序列,并以此为基础设计引物。                                     
    同时注意!!!这时的样品是要准备提取RNA的。在样本的准备以及保存时就要以RNA的标准来做。可千万别弄错了哦

  2. 查找DNA序列。一般目的是这样的:“我要检测在一定量的样本优游某个基因优游多少个拷贝数”。其优游拷贝数(copies)简单的说就是指某个基因的个数。这里所说的“基因”是指在DNA水平上的基因优游DNA。比如在一定重量的土壤优游一些种类比较接近的多种细菌优游可能优游一个类似的同名基因,则可根据检测这个基因在单位重量土壤优游的数目来推算土壤优游这些类细菌的数量。可以近似理解为“想知道优游多少个它”。这时就与上文所说的mRNA无关了。所以要查找的是DNA序列,并以此为基础设计引物。这时的样品是要准备提取DNA的。在样本的准备以及保存时就要以DNA的标准来做 




    




 

  

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